La rete formativa della Scuola di Pavia si compone di numerose sedi, tra le quali gli specializzandi devono ruotare durante i quattro anni di specializzazione. Sede principale della scuola è l’IRCCS Policlinico San Matteo di Pavia dove gli specializzandi possono eseguire prevalentemente il tronco comune nel reparto di medicina interna e il periodo in endoscopia. Fanno invece parte della rete formativa l’IRCCS Pavia ICS Maugeri (reparto di medicina interna, ambulatori di gastroenterologia generale e specialistici relativi a malattia di Whipple e celiachia), ASST Rhodense con sede a Rho e Garbagnate (prevalentemente per endoscopia), Ospedale di Cremona (endoscopia) e Spedali Civili di Brescia. Per quanto riguarda la sede di Brescia si specifica che ogni anno, a discrezione del direttore, uno specializzando viene assegnato a questa sede per tutta la durata del percorso formativo. Le rotazioni degli specializzandi all’interno della rete formativa si svolgono già a partire dal primo anno e sono stabilite dal Direttore della Scuola in funzione dl programma formativo.